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Plant-bacteria association and symbiosis: are there common genomic traits in Alphaproteobacteria?
2011 F.Pini; M.Galardini; M.Bazzicalupo; A.Mengoni
CONTIGuator
2011 M. Galardini; E.G. Biondi; M. Bazzicalupo; A. Mengoni
CONTIGuator: a bacterial genomes finishing tool for structural insights on draft genomes.
2011 M.Galardini; E.G.Biondi; M.Bazzicalupo; A.Mengoni
Exploring the symbiotic pangenome of the nitrogen-fixing bacterium Sinorhizobium meliloti
2011 M. Galardini;A. Mengoni;M. Brilli;F. Pini;A. Fioravanti;S. Lucas;A. Lapidus;J. Cheng;L. Goodwin;S. Pitluck;M. Land;L. Hauser;T. Woike;N. Mikhailova;N. Ivanova;H. Daligault;D. Bruce;C. Detter;R. Tapia;C. Han;H. Teshima;S. Mocali;M. Bazzicalupo;E. Biondi
Permanent draft genome sequences of the symbiotic nitrogen fixing Ensifer meliloti strains BO21CC and AK58
2013 M. Galardini;M. Bazzicalupo;E. Biondi;E. Brambilla;M. Brilli;D. Bruce;P. Chain;A. Chen;H. Daligault;K. W. Davenport;S. Deshpande;J. C. Detter;L. A. Goodwin;C. Han;J. Han;M. Huntemann;N. Ivanova;H. Klenk;N. C. Kyrpides;V. Markowitz;K. Mavrommatis;S. Mocali;M. Nolan;I. Pagani;A. Pati;F. Pini;S. Pitluck;G. Spini;E. Szeto;H. Teshima;T. Woyke; A. Mengoni
The DivJ, CbrA and PleC system controls DivK phosphorylation and symbiosis in Sinorhizobium meliloti
2013 F.Pini; B.Frage; L.Ferri; N.J.De Nisco; S.Mohapatra; L.Taddei; A.Fioravanti; F.Dewitte; M.Galardini; M.Brilli; V.Villeret; M.Bazzicalupo; A.Mengoni; G.C.Walker; A.Becker; E.G.Biondi
Draft Genome Sequence of Chromate-Resistant and Biofilm-Producing Strain Pseudomonas alcaliphila 34
2013 L. Santopolo;E. Marchi;F. Decorosi;M. Galardini;M. Brilli;L. Giovannetti;C. Viti
Replicon-dependent bacterial genome evolution: the case of Sinorhizobium meliloti
2013 M.Galardini; F.Pini; M.Bazzicalupo; E.G.Biondi; A.Mengoni
DuctApe
2014 M.Galardini; A.Mengoni; E.G.Biondi; R.Semeraro; A.Florio; M.Bazzicalupo; A. Benedetti; S.Mocali
Molecular phylogeny of the nickel-resistance gene nreB and functional role in the nickel sensitive symbiotic nitrogen fixing bacterium Sinorhizobium meliloti
2014 F.Pini; G.Spini; M.Galardini; M.Bazzicalupo; A.Benedetti; M.Chiancianesi; A.Florio; A.Lagomarsino; M.Migliore; S.Mocali; A.Mengoni
Evaluation of the Performances of Ribosomal Database Project (RDP) Classifier for Taxonomic Assignment of 16S rRNA Metabarcoding Sequences Generated from Illumina-Solexa NGS
2015 G.Bacci; A.Bani; M.Bazzicalupo; M.T.Ceccherini; M.Galardini; P.Nannipieri; G.Pietramellara; A.Mengoni
Bacterial Pangenomics
2015 A.Mengoni;M.Galardini;M.Fondi
Preface. Bacterial pangenomics
2015 Mengoni, Alessio; Fondi, Marco; Galardini, Marco
Mapping Contigs Using CONTIGuator
2015 M.Galardini; A.Mengoni; M.Bazzicalupo
Pangenome Evolution in the Symbiotic Nitrogen Fixer Sinorhizobium meliloti
2015 Galardini M.; Pini F.; Bazzicalupo M.; Biondi E.G.; Mengoni A.
From Pangenome to Panphenome and Back
2015 Marco Galardini;Alessio Mengoni;Stefano Mocali
Advances in Host Plant and Rhizobium Genomics to Enhance Symbiotic Nitrogen Fixation in Grain Legumes
2015 S.Dwivedi; K.Sahrawat; H.D.Upadhyaya; A.Mengoni; M.Galardini; M.Bazzicalupo; E.G.Biondi; M.Hungria; G.Kaschuk; M.Blair; R.Ortiz
Evolution of Intra-specific Regulatory Networks in a Multipartite Bacterial Genome
2015 Galardini, Marco; Brilli, Matteo; Spini, Giulia; Rossi, Matteo; Roncaglia, Bianca; Bani, Alessia; Chiancianesi, Manuela; Moretto, Marco; Engelen, Kristof; Bacci, Giovanni; Pini, Francesco; Biondi, Emanuele; Bazzicalupo, Marco; Mengoni, Alessio
Draft genome sequence of a highly virulent strain of the plant pathogen Dickeya solani, IFB0099
2015 M.Golanowska; M.Galardini; M.Bazzicalupo; N.Hugouvieux-Cotte-Pattat; A.Mengoni; M.Potrykus; M.Slawiak; E.Lojkowska
High-Throughput Phenomics Bacterial Pangenomics
2015 C. Viti; F. Decorosi; E. Marchi; M. Galardini; L. Giovannetti
Titolo | Data di pubblicazione | Autore(i) | File |
---|---|---|---|
Plant-bacteria association and symbiosis: are there common genomic traits in Alphaproteobacteria? | 2011 | F.Pini; M.Galardini; M.Bazzicalupo; A.Mengoni | |
CONTIGuator | 2011 | M. Galardini; E.G. Biondi; M. Bazzicalupo; A. Mengoni | |
CONTIGuator: a bacterial genomes finishing tool for structural insights on draft genomes. | 2011 | M.Galardini; E.G.Biondi; M.Bazzicalupo; A.Mengoni | |
Exploring the symbiotic pangenome of the nitrogen-fixing bacterium Sinorhizobium meliloti | 2011 | M. Galardini;A. Mengoni;M. Brilli;F. Pini;A. Fioravanti;S. Lucas;A. Lapidus;J. Cheng;L. Goodwin;S. Pitluck;M. Land;L. Hauser;T. Woike;N. Mikhailova;N. Ivanova;H. Daligault;D. Bruce;C. Detter;R. Tapia;C. Han;H. Teshima;S. Mocali;M. Bazzicalupo;E. Biondi | |
Permanent draft genome sequences of the symbiotic nitrogen fixing Ensifer meliloti strains BO21CC and AK58 | 2013 | M. Galardini;M. Bazzicalupo;E. Biondi;E. Brambilla;M. Brilli;D. Bruce;P. Chain;A. Chen;H. Daligault;K. W. Davenport;S. Deshpande;J. C. Detter;L. A. Goodwin;C. Han;J. Han;M. Huntemann;N. Ivanova;H. Klenk;N. C. Kyrpides;V. Markowitz;K. Mavrommatis;S. Mocali;M. Nolan;I. Pagani;A. Pati;F. Pini;S. Pitluck;G. Spini;E. Szeto;H. Teshima;T. Woyke; A. Mengoni | |
The DivJ, CbrA and PleC system controls DivK phosphorylation and symbiosis in Sinorhizobium meliloti | 2013 | F.Pini; B.Frage; L.Ferri; N.J.De Nisco; S.Mohapatra; L.Taddei; A.Fioravanti; F.Dewitte; M.Galardini; M.Brilli; V.Villeret; M.Bazzicalupo; A.Mengoni; G.C.Walker; A.Becker; E.G.Biondi | |
Draft Genome Sequence of Chromate-Resistant and Biofilm-Producing Strain Pseudomonas alcaliphila 34 | 2013 | L. Santopolo;E. Marchi;F. Decorosi;M. Galardini;M. Brilli;L. Giovannetti;C. Viti | |
Replicon-dependent bacterial genome evolution: the case of Sinorhizobium meliloti | 2013 | M.Galardini; F.Pini; M.Bazzicalupo; E.G.Biondi; A.Mengoni | |
DuctApe | 2014 | M.Galardini; A.Mengoni; E.G.Biondi; R.Semeraro; A.Florio; M.Bazzicalupo; A. Benedetti; S.Mocali | |
Molecular phylogeny of the nickel-resistance gene nreB and functional role in the nickel sensitive symbiotic nitrogen fixing bacterium Sinorhizobium meliloti | 2014 | F.Pini; G.Spini; M.Galardini; M.Bazzicalupo; A.Benedetti; M.Chiancianesi; A.Florio; A.Lagomarsino; M.Migliore; S.Mocali; A.Mengoni | |
Evaluation of the Performances of Ribosomal Database Project (RDP) Classifier for Taxonomic Assignment of 16S rRNA Metabarcoding Sequences Generated from Illumina-Solexa NGS | 2015 | G.Bacci; A.Bani; M.Bazzicalupo; M.T.Ceccherini; M.Galardini; P.Nannipieri; G.Pietramellara; A.Mengoni | |
Bacterial Pangenomics | 2015 | A.Mengoni;M.Galardini;M.Fondi | |
Preface. Bacterial pangenomics | 2015 | Mengoni, Alessio; Fondi, Marco; Galardini, Marco | |
Mapping Contigs Using CONTIGuator | 2015 | M.Galardini; A.Mengoni; M.Bazzicalupo | |
Pangenome Evolution in the Symbiotic Nitrogen Fixer Sinorhizobium meliloti | 2015 | Galardini M.; Pini F.; Bazzicalupo M.; Biondi E.G.; Mengoni A. | |
From Pangenome to Panphenome and Back | 2015 | Marco Galardini;Alessio Mengoni;Stefano Mocali | |
Advances in Host Plant and Rhizobium Genomics to Enhance Symbiotic Nitrogen Fixation in Grain Legumes | 2015 | S.Dwivedi; K.Sahrawat; H.D.Upadhyaya; A.Mengoni; M.Galardini; M.Bazzicalupo; E.G.Biondi; M.Hungria; G.Kaschuk; M.Blair; R.Ortiz | |
Evolution of Intra-specific Regulatory Networks in a Multipartite Bacterial Genome | 2015 | Galardini, Marco; Brilli, Matteo; Spini, Giulia; Rossi, Matteo; Roncaglia, Bianca; Bani, Alessia; Chiancianesi, Manuela; Moretto, Marco; Engelen, Kristof; Bacci, Giovanni; Pini, Francesco; Biondi, Emanuele; Bazzicalupo, Marco; Mengoni, Alessio | |
Draft genome sequence of a highly virulent strain of the plant pathogen Dickeya solani, IFB0099 | 2015 | M.Golanowska; M.Galardini; M.Bazzicalupo; N.Hugouvieux-Cotte-Pattat; A.Mengoni; M.Potrykus; M.Slawiak; E.Lojkowska | |
High-Throughput Phenomics Bacterial Pangenomics | 2015 | C. Viti; F. Decorosi; E. Marchi; M. Galardini; L. Giovannetti |
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