Primary biliary cirrhosis (PBC) is a classical autoimmune liver disease for which effective immunomodulatory therapy is lacking. Here we perform meta-analyses of discovery data sets from genome-wide association studies of European subjects (n=2,764 cases and 10,475 controls) followed by validation genotyping in an independent cohort (n=3,716 cases and 4,261 controls). We discover and validate six previously unknown risk loci for PBC (Pcombined<5 × 10(-8)) and used pathway analysis to identify JAK-STAT/IL12/IL27 signalling and cytokine-cytokine pathways, for which relevant therapies exist.
International genome-wide meta-analysis identifies new primary biliary cirrhosis risk loci and targetable pathogenic pathways / Heather J. Cordell; Younghun Han; George F. Mells; Yafang Li; Gideon M. Hirschfield; Casey S. Greene; Gang Xie; Brian D. Juran 7 ; Dakai Zhu 2 ; David C. Qian 2 ; James A.B. Floyd ; Katherine I. Morley ; Daniele Prati 11 ; Ana Lleo 12 ; Daniele Cusi ; M. Eric Gershwin 15 ; Carl A. Anderson 8 ; Konstantinos N. Lazaridis 7 ; Pietro Invernizzi ; Michael F. Seldin 15 ; Richard N. Sandford ; Christopher I. Amos 2; Katherine A. Siminovitch ; Erik M. Schlicht 7 ; Craig Lammert 7 ; Elizabeth J. Atkinson 19 ; Landon L. Chan 19 ; Mariza de Andrade 19 ; Tobias Balschun 20 ; Andrew L. Mason 21 ; Robert P. Myers 22 ; Jinyi Zhang 23 ; Piotr Milkiewicz 24 ; Jia Qu 25 ; Joseph A. Odin 26 ; Velimir A. Luketic 27 ; Bruce R. Bacon 28 ; Henry C. Bodenheimer Jr 29 ; Valentina Liakina 30 ; Catherine Vincent 31 ; Cynthia Levy 32 ;Peter K. Gregersen ;33 Piero L. Almasio ; Domenico Alvaro 35 ; Pietro Andreone 36 ; Angelo Andriulli 37 ; Cristina Barlassina 38 ; Pier Maria Battezzati 39 ; Antonio Benedetti 40 ; Francesca Bernuzzi 41 ; Ilaria Bianchi 41 ; Maria Consiglia Bragazzi 42 ; Maurizia Brunetto 43 ; Savino Bruno 41 ; Giovanni Casella 44 ; Barbara Coco 43 ; Agostino Colli 45 ; Massimo Colombo 46 ; Silvia Colombo 47 ; Carmela Cursaro 36 ; Lory Saveria Croce ` 48 ; Andrea Crosignani 39 ; Maria Francesca Donato 46 ; Gianfranco Elia 49 ; Luca Fabris 50 ; Carlo Ferrari 49 ; Annarosa Floreani 51 ; Barbara Foglieni 11 ; Rosanna Fontana 37 ; Andrea Galli 52 ; Roberta Lazzari 51 ; Fabio Macaluso 34 ; Federica Malinverno 46 ; Fabio Marra 53 ; Marco Marzioni 40 ; Alberto Mattalia 54 ; Renzo Montanari 55 ; Lorenzo Morini 56 ; Filomena Morisco 57 ; Mousa Hani S. 41 ; Luigi Muratori 36 ; Paolo Muratori 36 ; Grazia A. Niro 37 ; Vincenzo O. Palmieri 58 ; Antonio Picciotto 59 ; Mauro Podda 41 ; Piero Portincasa 58 ; Vincenzo Ronca 41 ; Floriano Rosina 60 ; Sonia Rossi 41 ; Ilaria Sogno 41 ; Giancarlo Spinzi 61 ; Marta Spreafico 11 ; Mario Strazzabosco ; Sonia Tarallo 60 ; Mirko Tarocchi 52 ; Claudio Tiribelli 48 ; Pierluigi Toniutto 64 ; Maria Vinci 65 ; Massimo Zuin ;Chin Lye Ch’ng ; Mesbah Rahman 68 ; Tom Yapp 69 ; Richard Sturgess 70 ; Christopher Healey 71 ; Marek Czajkowski ; Anton Gunasekera ; Pranab Gyawali 77 ; Purushothaman Premchand 78 ; Kapil Kapur 79 ; Richard Marley 80 ; Graham Foster 80 ; Alan Watson 81 ; Aruna Dias 82 ; Javaid Subhani 83 ; Rory Harvey 84 ; Roger McCorry 85 ; David Ramanaden 86 ; Jaber Gasem 87 ; Richard Evans 88 ; Thiriloganathan Mathialahan 89 ; Christopher Shorrock 90 ; George Lipscomb 91 ; Paul Southern 92 ; Jeremy Tibble 93;94 ; David Gorard ; Altaf Palegwala 98 ; Susan Jones ; Marco Carbone 101 ; Mohamed Dawwas 101 ; Graeme Alexander 101 ; Sunil Dolwani ; Martin Prince 104 ; Matthew Foxton 105 ; David Elphick 106 ; Harriet Mitchison 107 ; Ian Gooding 108 ; Mazn Karmo 109 ; Sushma Saksena ; Mike Mendall ; Minesh Patel ; Roland Ede ; Andrew Austin 119 ; Joanna Sayer ; Lorraine Hankey 122 ; Christopher Hovell 122 ; Neil Fisher 123 ; Martyn Carter ; Konrad Koss 126 ; Andrzej Piotrowicz ; Charles Grimley ; David Neal ; Guan Lim 135 ; Sass Levi ; Aftab Ala 138 ; Andrea Broad 139 ; Athar Saeed 139 ; Gordon Wood 140 ; Jonathan Brown ; Mark Wilkinson ; Harriet Gordon 145 ; John Ramage 146 ; Jo Ridpath 147 ; Theodore Ngatchu ; Bob Grover 151 ; Syed Shaukat 152 ; Ray Shidrawi 153 ; George Abouda ; Faiz Ali 156 ; Ian Rees 157 ; Imroz Salam 158 ; Mark Narain 159 ; Ashley Brown ; Simon Taylor-Robinson 162 ; Simon Williams 163 ; Leonie Grellier 164 ; Paul Banim 165 ; Debasish Das 166 ; Andrew Chilton 166 ; Michael Heneghan 167 ; Howard Curtis ; Markus Gess 170 ; Ian Drake ; Mark Aldersley ; Mervyn Davies ; Rebecca Jones ; Alastair McNair 175 ; Raj Srirajaskanthan 176 ; Maxton Pitcher ; Sambit Sen 179 ; George Bird ; Adrian Barnardo 182 ; Paul Kitchen 182 ; Kevin Yoong 183 ; Oza Chirag ; Nurani Sivaramakrishnan 186 ; George MacFaul 187 ; David Jones 188 ; Amir Shah 189 ; Chris Evans 190 ; Subrata Saha 191 ; Katharine Pollock ; Peter Bramley ; Ashis Mukhopadhya ; Andrew Fraser ; Peter Mills ; Christopher Shallcross ; Stewart Campbell ; Andrew Bathgate ; Alan Shepherd 213 ; John Dillon 214 ; Simon Rushbrook 215 ; Robert Przemioslo 216 Christopher Macdonald ; Jane Metcalf ; Udi Shmueli 221 ; Andrew Davis ; Asifabbas Naqvi ; Tom Lee ; Stephen D Ryder ; Jane Collier 231 ; Howard Klass ; Mary Ninkovic ; Matthew Cramp 238 ; Nicholas Sharer 239 ; Richard Aspinall 240 ; Patrick Goggin 240 ; Deb Ghosh ; Andrew Douds 243 ; Barbara Hoeroldt 244 ; Jonathan Booth 245 ; Earl Williams 246 ; Hyder Hussaini 247 ; William Stableforth 247 ; Reuben Ayres 248 ; Douglas Thorburn 249 ; Eileen Marshall 249 ; Andrew Burroughs 249 ; Steven Mann ; Martin Lombard 252 ; Paul Richardson 252 ; Imran Patanwala 252 ; Julia Maltby 253 ; Matthew Brookes 254 ; Ray Mathew ; Samir Vyas 257 ; Saket Singhal 258 ; Dermot Gleeson ; Sharat Misra ; Jeff Butterworth ; Keith George 265 ; Tim Harding ; Andrew Douglass ; Simon Panter 270 ; Jeremy Shearman 271 ; Gary Bray 272 ; Graham Butcher ; Daniel Forton 275 ; John Mclindon ; Matthew Cowan 279 ; Gregory Whatley 280 ; Aditya Mandal ; Hemant Gupta ; Pradeep Sanghi ; Sanjiv Jain 283 ; Steve Pereira 284 ; Geeta Prasad 285 ; Gill Watts 285 ; Mark Wright 286 ; James Neuberger 287 ; Fiona Gordon 288 ; Esther Unitt 289 ; Allister Grant ; Toby Delahooke ; Andrew Higham 293 ; Alison Brind 294 ; Mark Cox 295 ; Subramaniam Ramakrishnan 296 ; Alistair King ; Carole Collins 300 ; Simon Whalley ; Andy Li 303 ; Jocelyn Fraser 304 ; Andrew Bell 305 ; Voi Shim Wong 306 ; Amit Singhal ; Ian Gee ; Yeng Ang 312 ; Rupert Ransford 313 ; James Gotto 314 ; Charles Millson ; Jane Bowles 318 ; Caradog Thomas ; Melanie Harrison 70 ; Roman Galaska 71 ; Jennie Kendall ; Jessica Whiteman ; Caroline Lawlor ; Catherine Gray ; Keith Elliott 79 ; Caroline Mulvaney-Jones ; Lucie Hobson ; Greta Van Duyvenvoorde 90 ; Alison Loftus 91 ; Katie Seward 92 ; Ruth Penn ; Jane Maiden 98 ; Rose Damant 98 ; Janeane Hails 101 ; Rebecca Cloudsdale ; Valeria Silvestre 105 ; Sue Glenn 106 ; Eleanor Dungca 107 ; Natalie Wheatley 108 ; Helen Doyle 109 ; Melanie Kent ; Caroline Hamilton ; Delyth Braim ; Helen Wooldridge 117 ; Rachel Abrahams 117 ; Alison Paton 119 ; Nicola Lancaster ; Andrew Gibbins 122 ; Karen Hogben 122 ; Phillipa Desousa ; Florin Muscariu ; Janine Musselwhite ; Alexandra McKay 132 ; LaiTing Tan 135 ; Carole Foale 138 ; Jacqueline Brighton 138 ; Kerry Flahive 140 ; Estelle Nambela ; Paula Townshend ; Chris Ford ; Sophie Holder ; Caroline Palmer ; James Featherstone 147 ; Mariam Nasseri 151 ; Joy Sadeghian 153 ; Bronwen Williams ; Carol Thomas 156 ; Sally-Ann Rolls 156 ; Abigail Hynes 159 ; Claire Duggan 159 ; Sarah Jones 159 ; Mary Crossey ; Glynis Stansfield 163 ; Carolyn MacNicol 163 ; Joy Wilkins 164 ; Elva Wilhelmsen 165 ; Parizade Raymode 166 ; Hye-Jeong Lee 167 ; Emma Durant ; Rebecca Bishop ; Noma Ncube ; Sherill Tripoli ; Rebecca Casey ; Caroline Cowley 182 ; Richard Miller 183 ; Kathryn Houghton 188 ; Samantha Ducker 188 ; Fiona Wright 189 ; Bridget Bird 191 ; Gwen Baxter 191 ; Janie Keggans 191 ; Maggie Hughes ; Emma Grieve 196 ; Karin Young 196 ; D. Williams 197 ; Kate Ocker 199 ; Frances Hines ; Kirsty Martin ; Caron Innes ; Talal Valliani 216 ; Helen Fairlamb ; Sarah Thornthwaite ; Anne Eastick ; Elizabeth Tanqueray 221 ; Jennifer Morrison 222 ; Becky Holbrook 222 ; Julie Browning ; Kirsten Walker ; Susan Congreave ; Juliette Verheyden ; Susan Slininger ; Lizzie Stafford 231 ; Denise O’Donnell 231 ; Mark Ainsworth 231 ; Susan Lord 118 ; Linda Kent ; Linda March 238 ; Christine Dickson 239 ; Diane Simpson 239 ; Beverley Longhurst 240 ; Maria Hayes 240 ; Ervin Shpuza ; Nikki White ; Sarah Besley ; Sallyanne Pearson 244 ; Alice Wright 245 ; Linda Jones 245 ; Emma Gunter 246 ; Hannah Dewhurst 246 ; Anna Fouracres 247 ; Liz Farrington 247 ; Lyn Graves 247 ; Suzie Marriott 248 ; Marina Leoni 249 ; David Tyrer 252 ; Kate Martin 252 ; Lola Dali-kemmery 253 ; Victoria Lambourne 253 ; Marie Green 254 ; Dawn Sirdefield ; Kelly Amor 255 ; Julie Colley 258 ; Bal Shinder 258 ; Jayne Jones 260 ; Marisa Mills 260 ; Mandy Carnahan ; Natalie Taylor 265 ; Kerenza Boulton 265 ; Julie Tregonning ; Carly Brown 270 ; Gayle Clifford 270 ; Emily Archer 271 ; Maria Hamilton ; Janette Curtis 278 ; Tracey Shewan 279 ; Sue Walsh 280 ; Karen Warner ; Kimberley Netherton 283 ; Mcdonald Mupudzi 286 ; Bridget Gunson 287 ; Jane Gitahi 288 ; Denise Gocher 289 ; Sally Batham ; Hilary Pateman ; Senayon Desmennu ; Jill Conder 293 ; Darren Clement 294 ; Susan Gallagher 294 ; Jacky Orpe 256 ; PuiChing Chan 296 ; Lynn Currie ; Lynn O’Donohoe ; Metod Oblak 300 ; Lisa Morgan 302 ; Marie Quinn 303 ; Isobel Amey 304 ; Yolanda Baird 304 ; Donna Cotterill 305 ; Lourdes Cumlat 306 ; Louise Winter 312 ; Sandra Greer 312 ; Katie Spurdle ; Joanna Allison ; Simon Dyer ; Helen Sweeting ; Jean Kordula. - In: NATURE COMMUNICATIONS. - ISSN 2041-1723. - ELETTRONICO. - (2015), pp. 1-11.
International genome-wide meta-analysis identifies new primary biliary cirrhosis risk loci and targetable pathogenic pathways
GALLI, ANDREA;MARRA, FABIO;TAROCCHI, MIRKO;
2015
Abstract
Primary biliary cirrhosis (PBC) is a classical autoimmune liver disease for which effective immunomodulatory therapy is lacking. Here we perform meta-analyses of discovery data sets from genome-wide association studies of European subjects (n=2,764 cases and 10,475 controls) followed by validation genotyping in an independent cohort (n=3,716 cases and 4,261 controls). We discover and validate six previously unknown risk loci for PBC (Pcombined<5 × 10(-8)) and used pathway analysis to identify JAK-STAT/IL12/IL27 signalling and cytokine-cytokine pathways, for which relevant therapies exist.File | Dimensione | Formato | |
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