Attenzione: i dati modificati non sono ancora stati salvati. Per confermare inserimenti o cancellazioni di voci è necessario confermare con il tasto SALVA/INSERISCI in fondo alla pagina
Recent studies suggest that closely related species can accumulate substantial genetic and phenotypic differences despite ongoing gene flow, thus challenging traditional ideas regarding the genetics of speciation. Baboons (genus Papio) are Old World monkeys consisting of six readily distinguishable species. Baboon species hybridize in the wild, and prior data imply a complex history of differentiation and introgression. We produced a reference genome assembly for the olive baboon (Papio anubis) and whole-genome sequence data for all six extant species. We document multiple episodes of admixture and introgression during the radiation of Papio baboons, thus demonstrating their value as a model of complex evolutionary divergence, hybridization, and reticulation. These results help inform our understanding of similar cases, including modern humans, Neanderthals, Denisovans, and other ancient hominins.
The comparative genomics and complex population history of Papio baboons / Rogers, Jeffrey; Raveendran, Muthuswamy; Harris, R. Alan; Mailund, Thomas; Leppälä, Kalle; Athanasiadis, Georgios; Schierup, Mikkel Heide; Cheng, Jade; Munch, Kasper; Walker, Jerilyn A.; Konkel, Miriam K.; Jordan, Vallmer E.; Steely, Cody J.; Beckstrom, Thomas O.; Bergey, Christina; Burrell, Andrew; Schrempf, Dominik; Noll, Angela; Kothe, Maximillian; Kopp, Gisela H.; Liu, Yue; Murali, Shwetha; Billis, Konstantinos; Martin, Fergal J.; Muffato, Matthieu; Cox, Laura A.; Else, James; Disotell, Todd; Muzny, Donna M.; Phillips-Conroy, Jane; Aken, Bronwen; Eichler, Evan E.; Marques-Bonet, Tomas; Kosiol, Carolin; Batzer, Mark A.; Hahn, Matthew W.; Tung, Jenny; Zinner, Dietmar; Roos, Christian; Jolly, Clifford J.; Gibbs, Richard A.; Worley, Kim C.; Archidiacono, Nicoletta; Capozzi, Oronzo; Catacchio, Claudia R.; Dinh, Huyen H.; Doddapaneni, Harsha Vardhan; Han, Yi; Huddleston, John; Jhangiani, Shalini N.; Karimpour-Fard, Anis; Korchina, Viktoriya; Kovar, Christie L.; Kuderna, Lukas; Lee, Sandra L.; Liu, Xiaoming; Marra-Campanale, Alessia; Mason, Christopher E.; Montero, Marc de Manuel; Pagel, Kymberleigh A.; Palazzo, Antonio; Pecotte, Jera; Pejaver, Vikas; Pipes, Lenore; Quick, Veronica Searles; Radivojac, Predrag; Raja, Archana; Raney, Brian J.; Rice, Karen; Rocchi, Mariano; Sikela, James M.; Stanyon, Roscoe; Thomas, Gregg W. C.; Ventura, Mario; Vilgalys, Tauras P.; Vinar, Tomas; Walter, Lutz. - In: SCIENCE ADVANCES. - ISSN 2375-2548. - ELETTRONICO. - 5:(2019), pp. 0-0. [10.1126/sciadv.aau6947]
The comparative genomics and complex population history of Papio baboons
Rogers, Jeffrey;Raveendran, Muthuswamy;Harris, R. Alan;Mailund, Thomas;Leppälä, Kalle;Athanasiadis, Georgios;Schierup, Mikkel Heide;Cheng, Jade;Munch, Kasper;Walker, Jerilyn A.;Konkel, Miriam K.;Jordan, Vallmer E.;Steely, Cody J.;Beckstrom, Thomas O.;Bergey, Christina;Burrell, Andrew;Schrempf, Dominik;Noll, Angela;Kothe, Maximillian;Kopp, Gisela H.;Liu, Yue;Murali, Shwetha;Billis, Konstantinos;Martin, Fergal J.;Muffato, Matthieu;Cox, Laura A.;Else, James;Disotell, Todd;Muzny, Donna M.;Phillips-Conroy, Jane;Aken, Bronwen;Eichler, Evan E.;Marques-Bonet, Tomas;Kosiol, Carolin;Batzer, Mark A.;Hahn, Matthew W.;Tung, Jenny;Zinner, Dietmar;Roos, Christian;Jolly, Clifford J.;Gibbs, Richard A.;Worley, Kim C.;Archidiacono, Nicoletta;Capozzi, Oronzo;Catacchio, Claudia R.;Dinh, Huyen H.;Doddapaneni, Harsha Vardhan;Han, Yi;Huddleston, John;Jhangiani, Shalini N.;Karimpour-Fard, Anis;Korchina, Viktoriya;Kovar, Christie L.;Kuderna, Lukas;Lee, Sandra L.;Liu, Xiaoming;Marra-Campanale, Alessia;Mason, Christopher E.;Montero, Marc de Manuel;Pagel, Kymberleigh A.;PALAZZO, ANTONIO;Pecotte, Jera;Pejaver, Vikas;Pipes, Lenore;Quick, Veronica Searles;Radivojac, Predrag;Raja, Archana;Raney, Brian J.;Rice, Karen;Rocchi, Mariano;Sikela, James M.;Stanyon, Roscoe;Thomas, Gregg W. C.;Ventura, Mario;Vilgalys, Tauras P.;Vinar, Tomas;Walter, Lutz
2019
Abstract
Recent studies suggest that closely related species can accumulate substantial genetic and phenotypic differences despite ongoing gene flow, thus challenging traditional ideas regarding the genetics of speciation. Baboons (genus Papio) are Old World monkeys consisting of six readily distinguishable species. Baboon species hybridize in the wild, and prior data imply a complex history of differentiation and introgression. We produced a reference genome assembly for the olive baboon (Papio anubis) and whole-genome sequence data for all six extant species. We document multiple episodes of admixture and introgression during the radiation of Papio baboons, thus demonstrating their value as a model of complex evolutionary divergence, hybridization, and reticulation. These results help inform our understanding of similar cases, including modern humans, Neanderthals, Denisovans, and other ancient hominins.
I documenti in FLORE sono protetti da copyright e tutti i diritti sono riservati, salvo diversa indicazione.
Utilizza questo identificatore per citare o creare un link a questa risorsa: https://hdl.handle.net/2158/1151619
Citazioni
ND
95
84
social impact
Conferma cancellazione
Sei sicuro che questo prodotto debba essere cancellato?
simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.