OBIETTIVI: a circa due mesi dalla fine del lockdown imposto per il contenimento dell’epidemia di SARS-CoV-2, si sono valutate le dinamiche del contagio nella Regione Toscana dall’inizio dell’emergenza a fine giugno attraverso un modello compartimentale, successivamente utilizzato per produrre semplici previsioni degli andamenti epidemici per i prossimi mesi. DATI E METODI: è stato costruito un modello compartimentale di tipo SIRD, in cui il tasso di riproduzione dell’infezione (R0) è stato assunto variabile nel tempo, tramite una funzione costante a tratti. Fissati, per motivi di identificabilità, alcuni parametri – la letalità e il tempo dal contagio alla risoluzione dell’infezione (morte o guarigione) – il modello è stato calibrato sulla serie dei decessi per malattia Covid-19 notificati nel periodo dal 09.03.2020 al 30.06.2020. L’incertezza attorno alle stime è stata quantificata attraverso un bootstrap parametrico. Il modello stimato è stato poi utilizzato per produrre proiezioni a medio-lungo termine delle dinamiche epidemiche. RISULTATI: la data di inizio epidemia in Toscana è stata stimata al 21.02.2020. Il valore stimato di R0(t) è andato da un iniziale 7,78 (IC95% 7,55-7,89) a un valore molto vicino a 0 tra il 27 aprile e il 17 maggio. Infine, esso è risalito, fino a raggiungere un valore medio di 0,66 (0,32-0,88) tra il 18 maggio e il 30 giugno. In corrispondenza del picco epidemico, stimato all’inizio di aprile, gli infetti notificati circolanti in regione risultavano appena il 22% di quelli predetti dal SIRD. In accordo al modello, se a partire da ottobre R 0 (t) superasse, anche di poco, l’unità, l’onda del contagio potrebbe raggiungere nuovamente livelli preoccupanti entro la prossima primavera. CONCLUSIONI: l’andamento stimato di R0(t) suggerisce la presenza di un forte effetto delle politiche di contenimento sulla diffusione del virus in Toscana e di una minima ripresa del contagio potenzialmente attribuibile all’interruzione del lockdown. Le proiezioni a medio-lungo termine mostrano inequivocabilmente come il pericolo di una nuova ondata epidemica non sia scongiurato.

Analisi e previsioni dell’epidemia da SARS-CoV-2 in Toscana / Analysis and future scenarios of the SARS-CoV-2 epidemic in Tuscany Region (Central Italy) / Giulia Cereda; Cecilia Viscardi; Anna Gottard; Fabrizia Mealli; Michela Baccini. - In: EPIDEMIOLOGIA E PREVENZIONE. - ISSN 1120-9763. - STAMPA. - 44:(2020), pp. 120-127. [10.19191/EP20.5-6.S2.110]

Analisi e previsioni dell’epidemia da SARS-CoV-2 in Toscana / Analysis and future scenarios of the SARS-CoV-2 epidemic in Tuscany Region (Central Italy)

Giulia Cereda;Cecilia Viscardi;Anna Gottard;Fabrizia Mealli;Michela Baccini
2020

Abstract

OBIETTIVI: a circa due mesi dalla fine del lockdown imposto per il contenimento dell’epidemia di SARS-CoV-2, si sono valutate le dinamiche del contagio nella Regione Toscana dall’inizio dell’emergenza a fine giugno attraverso un modello compartimentale, successivamente utilizzato per produrre semplici previsioni degli andamenti epidemici per i prossimi mesi. DATI E METODI: è stato costruito un modello compartimentale di tipo SIRD, in cui il tasso di riproduzione dell’infezione (R0) è stato assunto variabile nel tempo, tramite una funzione costante a tratti. Fissati, per motivi di identificabilità, alcuni parametri – la letalità e il tempo dal contagio alla risoluzione dell’infezione (morte o guarigione) – il modello è stato calibrato sulla serie dei decessi per malattia Covid-19 notificati nel periodo dal 09.03.2020 al 30.06.2020. L’incertezza attorno alle stime è stata quantificata attraverso un bootstrap parametrico. Il modello stimato è stato poi utilizzato per produrre proiezioni a medio-lungo termine delle dinamiche epidemiche. RISULTATI: la data di inizio epidemia in Toscana è stata stimata al 21.02.2020. Il valore stimato di R0(t) è andato da un iniziale 7,78 (IC95% 7,55-7,89) a un valore molto vicino a 0 tra il 27 aprile e il 17 maggio. Infine, esso è risalito, fino a raggiungere un valore medio di 0,66 (0,32-0,88) tra il 18 maggio e il 30 giugno. In corrispondenza del picco epidemico, stimato all’inizio di aprile, gli infetti notificati circolanti in regione risultavano appena il 22% di quelli predetti dal SIRD. In accordo al modello, se a partire da ottobre R 0 (t) superasse, anche di poco, l’unità, l’onda del contagio potrebbe raggiungere nuovamente livelli preoccupanti entro la prossima primavera. CONCLUSIONI: l’andamento stimato di R0(t) suggerisce la presenza di un forte effetto delle politiche di contenimento sulla diffusione del virus in Toscana e di una minima ripresa del contagio potenzialmente attribuibile all’interruzione del lockdown. Le proiezioni a medio-lungo termine mostrano inequivocabilmente come il pericolo di una nuova ondata epidemica non sia scongiurato.
2020
44
120
127
Goal 3: Good health and well-being for people
Giulia Cereda; Cecilia Viscardi; Anna Gottard; Fabrizia Mealli; Michela Baccini
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