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The era of reference genomes in conservation genomics
2022 Formenti G.; Theissinger K.; Fernandes C.; Bista I.; Bombarely A.; Bleidorn C.; Ciofi C.; Crottini A.; Godoy J.A.; Hoglund J.; Malukiewicz J.; Mouton A.; Oomen R.A.; Paez S.; Palsboll P.J.; Pampoulie C.; Ruiz-Lopez M.J.; Svardal H.; Theofanopoulou C.; de Vries J.; Waldvogel A.-M.; Zhang G.; Mazzoni C.J.; Jarvis E.D.; Balint M.; Ciampor F.; Hoglund J.; Palsboll P.; Ruiz-Lopez M.J.; Zhang G.; Jarvis E.; Aghayan S.A.; Alioto T.S.; Almudi I.; Alvarez N.; Alves P.C.; Amorim I.R.; Antunes A.; Arribas P.; Baldrian P.; Berg P.R.; Bertorelle G.; Bohne A.; Bonisoli-Alquati A.; Bostjancic L.L.; Boussau B.; Breton C.M.; Buzan E.; Campos P.F.; Carreras C.; Castro L.F.; Chueca L.J.; Conti E.; Cook-Deegan R.; Croll D.; Cunha M.V.; Delsuc F.; Dennis A.B.; Dimitrov D.; Faria R.; Favre A.; Fedrigo O.D.; Fernandez R.; Ficetola G.F.; Flot J.-F.; Gabaldon T.; Galea Agius D.R.; Gallo G.R.; Giani A.M.; Gilbert M.T.P.; Grebenc T.; Guschanski K.; Guyot R.; Hausdorf B.; Hawlitschek O.; Heintzman P.D.; Heinze B.; Hiller M.; Husemann M.; Iannucci A.; Irisarri I.; Jakobsen K.S.; Jentoft S.; Klinga P.; Kloch A.; Kratochwil C.F.; Kusche H.; Layton K.K.S.; Leonard J.A.; Lerat E.; Liti G.; Manousaki T.; Marques-Bonet T.; Matos-Maravi P.; Matschiner M.; Maumus F.; Mc Cartney A.M.; Meiri S.; Melo-Ferreira J.; Mengual X.; Monaghan M.T.; Montagna M.; Myslajek R.W.; Neiber M.T.; Nicolas V.; Novo M.; Ozretic P.; Palero F.; Parvulescu L.; Pascual M.; Paulo O.S.; Pavlek M.; Pegueroles C.; Pellissier L.; Pesole G.; Primmer C.R.; Riesgo A.; Ruber L.; Rubolini D.; Salvi D.; Seehausen O.; Seidel M.; Secomandi S.; Studer B.; Theodoridis S.; Thines M.; Urban L.; Vasemagi A.; Vella A.; Vella N.; Vernes S.C.; Vernesi C.; Vieites D.R.; Waterhouse R.M.; Wheat C.W.; Worheide G.; Wurm Y.; Zammit G.
Ecological, physiological and life-history traits correlate with genome sizes in decapod crustaceans
2022 Iannucci, Alessio; Saha, Anik; Cannicci, Stefano; Bellucci, Arianna; Cheng, Christine L. Y.; Ng, Ka Hei; Fratini, Sara
Species-specific gill's microbiome of eight crab species with different breathing adaptations
2023 Bacci, Giovanni; Meriggi, Niccolò; Cheng, Christine L Y; Ng, Ka Hei; Iannucci, Alessio; Mengoni, Alessio; Cavalieri, Duccio; Cannicci, Stefano; Fratini, Sara
Conserved organ-specific microbial assemblages in different populations of a terrestrial crab
2023 Bacci, Giovanni; Fratini, Sara; Meriggi, Niccolò; Cheng, Christine L. Y.; Ng, Ka Hei; Pindo, Massimo; Iannucci, Alessio; Mengoni, Alessio; Cavalieri, Duccio; Cannicci, Stefano
Chemosensory proteins as putative semiochemical carriers in the desert isopod Hemilepistus reaumurii
2023 Iannucci, Alessio; Zhu, Jiao; Antonielli, Livio; Ayari, Anas; Nasri-Ammar, Karima; Knoll, Wolfgang; Pelosi, Paolo; Dani, Francesca Romana
A high-quality reference genome for the critically endangered Aeolian wall lizard, Podarcis raffonei
2023 Gabrielli M.; Benazzo A.; Biello R.; Ancona L.; Fuselli S.; Iannucci A.; Balacco J.; Mountcastle J.; Tracey A.; Ficetola G.F.; Salvi D.; Sollitto M.; Fedrigo O.; Formenti G.; Jarvis E.D.; Gerdol M.; Ciofi C.; Trucchi E.; Bertorelle G.
A chromosome-level reference genome and pangenome for barn swallow population genomics
2023 Secomandi S.; Gallo G.R.; Sozzoni M.; Iannucci A.; Galati E.; Abueg L.; Balacco J.; Caprioli M.; Chow W.; Ciofi C.; Collins J.; Fedrigo O.; Ferretti L.; Fungtammasan A.; Haase B.; Howe K.; Kwak W.; Lombardo G.; Masterson P.; Messina G.; Moller A.P.; Mountcastle J.; Mousseau T.A.; Ferrer Obiol J.; Olivieri A.; Rhie A.; Rubolini D.; Saclier M.; Stanyon R.; Stucki D.; Thibaud-Nissen F.; Torrance J.; Torroni A.; Weber K.; Ambrosini R.; Bonisoli-Alquati A.; Jarvis E.D.; Gianfranceschi L.; Formenti G.
How genomics can help biodiversity conservation
2023 Theissinger K.; Fernandes C.; Formenti G.; Bista I.; Berg P.R.; Bleidorn C.; Bombarely A.; Crottini A.; Gallo G.R.; Godoy J.A.; Jentoft S.; Malukiewicz J.; Mouton A.; Oomen R.A.; Paez S.; Palsboll P.J.; Pampoulie C.; Ruiz-Lopez M.J.; Secomandi S.; Svardal H.; Theofanopoulou C.; de Vries J.; Waldvogel A.-M.; Zhang G.; Jarvis E.D.; Balint M.; Ciofi C.; Waterhouse R.M.; Mazzoni C.J.; Hoglund J.; Aghayan S.A.; Alioto T.S.; Almudi I.; Alvarez N.; Alves P.C.; Amorim do Rosario I.R.; Antunes A.; Arribas P.; Baldrian P.; Bertorelle G.; Bohne A.; Bonisoli-Alquati A.; Bostjancic L.L.; Boussau B.; Breton C.M.; Buzan E.; Campos P.F.; Carreras C.; Castro L.F.C.; Chueca L.J.; Ciampor F.; Conti E.; Cook-Deegan R.; Croll D.; Cunha M.V.; Delsuc F.; Dennis A.B.; Dimitrov D.; Faria R.; Favre A.; Fedrigo O.D.; Fernandez R.; Ficetola G.F.; Flot J.-F.; Gabaldon T.; Agius D.R.; Giani A.M.; Gilbert M.T.P.; Grebenc T.; Guschanski K.; Guyot R.; Hausdorf B.; Hawlitschek O.; Heintzman P.D.; Heinze B.; Hiller M.; Husemann M.; Iannucci A.; Irisarri I.; Jakobsen K.S.; Klinga P.; Kloch A.; Kratochwil C.F.; Kusche H.; Layton K.K.S.; Leonard J.A.; Lerat E.; Liti G.; Manousaki T.; Marques-Bonet T.; Matos-Maravi P.; Matschiner M.; Maumus F.; Mc Cartney A.M.; Meiri S.; Melo-Ferreira J.; Mengual X.; Monaghan M.T.; Montagna M.; Myslajek R.W.; Neiber M.T.; Nicolas V.; Novo M.; Ozretic P.; Palero F.; Parvulescu L.; Pascual M.; Paulo O.S.; Pavlek M.; Pegueroles C.; Pellissier L.; Pesole G.; Primmer C.R.; Riesgo A.; Ruber L.; Rubolini D.; Salvi D.; Seehausen O.; Seidel M.; Studer B.; Theodoridis S.; Thines M.; Urban L.; Vasemagi A.; Vella A.; Vella N.; Vernes S.C.; Vernesi C.; Vieites D.R.; Wheat C.W.; Worheide G.; Wurm Y.; Zammit G.
Ecological factors and parity mode correlate with genome size variation in squamate reptiles
2023 Saha A.; Bellucci A.; Fratini S.; Cannicci S.; Ciofi C.; Iannucci A.
A multidisciplinary integrated approach using Pachygrapsus marmoratus to assess the impact of port activities on mediterranean marine protected areas
2023 Caliani, Ilaria; Cannicci, Stefano; Pretti, Carlo; Baratti, Mariella; Contini, Ginevra; Vitale, Matteo; Casini, Silvia; Fossi, Maria Cristina; Iannucci, Alessio; Fratini, Sara
Early detection of rare and elusive endangered species using environmental DNA: a case study for the Eurasian otter and the white-clawed crayfish in northwestern Italy
2024 Ballini, Lorenzo; Ottonello, Dario; Repetto, Valentina; Natali, Chiara; Chini, Giacomo; Tolve, Livia; Ciofi, Claudio; Fratini, Sara; Iannucci, Alessio
Whole mitochondrial genome sequencing provides new insights into the phylogeography of loggerhead turtles (Caretta caretta) in the Mediterranean Sea
2024 Tolve, Livia; Iannucci, Alessio; Garofalo, Luisa; Ninni, Andrea; Capobianco Dondona, Andrea; Ceciarini, Ilaria; Cocumelli, Cristiano; De Lucia, Alessandra; Falconi, Mattia; Formia, Angela; Iacovelli, Federico; Mancusi, Cecilia; Marchiori, Erica; Marsili, Letizia; Mingozzi, Toni; Nannarelli, Stefano; Natali, Chiara; Terracciano, Giuliana; Zuffi, Marco A. L.; Novelletto, Andrea; Ciofi, Claudio
| Titolo | Data di pubblicazione | Autore(i) | File |
|---|---|---|---|
| The era of reference genomes in conservation genomics | 2022 | Formenti G.; Theissinger K.; Fernandes C.; Bista I.; Bombarely A.; Bleidorn C.; Ciofi C.; Crottini A.; Godoy J.A.; Hoglund J.; Malukiewicz J.; Mouton A.; Oomen R.A.; Paez S.; Palsboll P.J.; Pampoulie C.; Ruiz-Lopez M.J.; Svardal H.; Theofanopoulou C.; de Vries J.; Waldvogel A.-M.; Zhang G.; Mazzoni C.J.; Jarvis E.D.; Balint M.; Ciampor F.; Hoglund J.; Palsboll P.; Ruiz-Lopez M.J.; Zhang G.; Jarvis E.; Aghayan S.A.; Alioto T.S.; Almudi I.; Alvarez N.; Alves P.C.; Amorim I.R.; Antunes A.; Arribas P.; Baldrian P.; Berg P.R.; Bertorelle G.; Bohne A.; Bonisoli-Alquati A.; Bostjancic L.L.; Boussau B.; Breton C.M.; Buzan E.; Campos P.F.; Carreras C.; Castro L.F.; Chueca L.J.; Conti E.; Cook-Deegan R.; Croll D.; Cunha M.V.; Delsuc F.; Dennis A.B.; Dimitrov D.; Faria R.; Favre A.; Fedrigo O.D.; Fernandez R.; Ficetola G.F.; Flot J.-F.; Gabaldon T.; Galea Agius D.R.; Gallo G.R.; Giani A.M.; Gilbert M.T.P.; Grebenc T.; Guschanski K.; Guyot R.; Hausdorf B.; Hawlitschek O.; Heintzman P.D.; Heinze B.; Hiller M.; Husemann M.; Iannucci A.; Irisarri I.; Jakobsen K.S.; Jentoft S.; Klinga P.; Kloch A.; Kratochwil C.F.; Kusche H.; Layton K.K.S.; Leonard J.A.; Lerat E.; Liti G.; Manousaki T.; Marques-Bonet T.; Matos-Maravi P.; Matschiner M.; Maumus F.; Mc Cartney A.M.; Meiri S.; Melo-Ferreira J.; Mengual X.; Monaghan M.T.; Montagna M.; Myslajek R.W.; Neiber M.T.; Nicolas V.; Novo M.; Ozretic P.; Palero F.; Parvulescu L.; Pascual M.; Paulo O.S.; Pavlek M.; Pegueroles C.; Pellissier L.; Pesole G.; Primmer C.R.; Riesgo A.; Ruber L.; Rubolini D.; Salvi D.; Seehausen O.; Seidel M.; Secomandi S.; Studer B.; Theodoridis S.; Thines M.; Urban L.; Vasemagi A.; Vella A.; Vella N.; Vernes S.C.; Vernesi C.; Vieites D.R.; Waterhouse R.M.; Wheat C.W.; Worheide G.; Wurm Y.; Zammit G. | |
| Ecological, physiological and life-history traits correlate with genome sizes in decapod crustaceans | 2022 | Iannucci, Alessio; Saha, Anik; Cannicci, Stefano; Bellucci, Arianna; Cheng, Christine L. Y.; Ng, Ka Hei; Fratini, Sara | |
| Species-specific gill's microbiome of eight crab species with different breathing adaptations | 2023 | Bacci, Giovanni; Meriggi, Niccolò; Cheng, Christine L Y; Ng, Ka Hei; Iannucci, Alessio; Mengoni, Alessio; Cavalieri, Duccio; Cannicci, Stefano; Fratini, Sara | |
| Conserved organ-specific microbial assemblages in different populations of a terrestrial crab | 2023 | Bacci, Giovanni; Fratini, Sara; Meriggi, Niccolò; Cheng, Christine L. Y.; Ng, Ka Hei; Pindo, Massimo; Iannucci, Alessio; Mengoni, Alessio; Cavalieri, Duccio; Cannicci, Stefano | |
| Chemosensory proteins as putative semiochemical carriers in the desert isopod Hemilepistus reaumurii | 2023 | Iannucci, Alessio; Zhu, Jiao; Antonielli, Livio; Ayari, Anas; Nasri-Ammar, Karima; Knoll, Wolfgang; Pelosi, Paolo; Dani, Francesca Romana | |
| A high-quality reference genome for the critically endangered Aeolian wall lizard, Podarcis raffonei | 2023 | Gabrielli M.; Benazzo A.; Biello R.; Ancona L.; Fuselli S.; Iannucci A.; Balacco J.; Mountcastle J.; Tracey A.; Ficetola G.F.; Salvi D.; Sollitto M.; Fedrigo O.; Formenti G.; Jarvis E.D.; Gerdol M.; Ciofi C.; Trucchi E.; Bertorelle G. | |
| A chromosome-level reference genome and pangenome for barn swallow population genomics | 2023 | Secomandi S.; Gallo G.R.; Sozzoni M.; Iannucci A.; Galati E.; Abueg L.; Balacco J.; Caprioli M.; Chow W.; Ciofi C.; Collins J.; Fedrigo O.; Ferretti L.; Fungtammasan A.; Haase B.; Howe K.; Kwak W.; Lombardo G.; Masterson P.; Messina G.; Moller A.P.; Mountcastle J.; Mousseau T.A.; Ferrer Obiol J.; Olivieri A.; Rhie A.; Rubolini D.; Saclier M.; Stanyon R.; Stucki D.; Thibaud-Nissen F.; Torrance J.; Torroni A.; Weber K.; Ambrosini R.; Bonisoli-Alquati A.; Jarvis E.D.; Gianfranceschi L.; Formenti G. | |
| How genomics can help biodiversity conservation | 2023 | Theissinger K.; Fernandes C.; Formenti G.; Bista I.; Berg P.R.; Bleidorn C.; Bombarely A.; Crottini A.; Gallo G.R.; Godoy J.A.; Jentoft S.; Malukiewicz J.; Mouton A.; Oomen R.A.; Paez S.; Palsboll P.J.; Pampoulie C.; Ruiz-Lopez M.J.; Secomandi S.; Svardal H.; Theofanopoulou C.; de Vries J.; Waldvogel A.-M.; Zhang G.; Jarvis E.D.; Balint M.; Ciofi C.; Waterhouse R.M.; Mazzoni C.J.; Hoglund J.; Aghayan S.A.; Alioto T.S.; Almudi I.; Alvarez N.; Alves P.C.; Amorim do Rosario I.R.; Antunes A.; Arribas P.; Baldrian P.; Bertorelle G.; Bohne A.; Bonisoli-Alquati A.; Bostjancic L.L.; Boussau B.; Breton C.M.; Buzan E.; Campos P.F.; Carreras C.; Castro L.F.C.; Chueca L.J.; Ciampor F.; Conti E.; Cook-Deegan R.; Croll D.; Cunha M.V.; Delsuc F.; Dennis A.B.; Dimitrov D.; Faria R.; Favre A.; Fedrigo O.D.; Fernandez R.; Ficetola G.F.; Flot J.-F.; Gabaldon T.; Agius D.R.; Giani A.M.; Gilbert M.T.P.; Grebenc T.; Guschanski K.; Guyot R.; Hausdorf B.; Hawlitschek O.; Heintzman P.D.; Heinze B.; Hiller M.; Husemann M.; Iannucci A.; Irisarri I.; Jakobsen K.S.; Klinga P.; Kloch A.; Kratochwil C.F.; Kusche H.; Layton K.K.S.; Leonard J.A.; Lerat E.; Liti G.; Manousaki T.; Marques-Bonet T.; Matos-Maravi P.; Matschiner M.; Maumus F.; Mc Cartney A.M.; Meiri S.; Melo-Ferreira J.; Mengual X.; Monaghan M.T.; Montagna M.; Myslajek R.W.; Neiber M.T.; Nicolas V.; Novo M.; Ozretic P.; Palero F.; Parvulescu L.; Pascual M.; Paulo O.S.; Pavlek M.; Pegueroles C.; Pellissier L.; Pesole G.; Primmer C.R.; Riesgo A.; Ruber L.; Rubolini D.; Salvi D.; Seehausen O.; Seidel M.; Studer B.; Theodoridis S.; Thines M.; Urban L.; Vasemagi A.; Vella A.; Vella N.; Vernes S.C.; Vernesi C.; Vieites D.R.; Wheat C.W.; Worheide G.; Wurm Y.; Zammit G. | |
| Ecological factors and parity mode correlate with genome size variation in squamate reptiles | 2023 | Saha A.; Bellucci A.; Fratini S.; Cannicci S.; Ciofi C.; Iannucci A. | |
| A multidisciplinary integrated approach using Pachygrapsus marmoratus to assess the impact of port activities on mediterranean marine protected areas | 2023 | Caliani, Ilaria; Cannicci, Stefano; Pretti, Carlo; Baratti, Mariella; Contini, Ginevra; Vitale, Matteo; Casini, Silvia; Fossi, Maria Cristina; Iannucci, Alessio; Fratini, Sara | |
| Early detection of rare and elusive endangered species using environmental DNA: a case study for the Eurasian otter and the white-clawed crayfish in northwestern Italy | 2024 | Ballini, Lorenzo; Ottonello, Dario; Repetto, Valentina; Natali, Chiara; Chini, Giacomo; Tolve, Livia; Ciofi, Claudio; Fratini, Sara; Iannucci, Alessio | |
| Whole mitochondrial genome sequencing provides new insights into the phylogeography of loggerhead turtles (Caretta caretta) in the Mediterranean Sea | 2024 | Tolve, Livia; Iannucci, Alessio; Garofalo, Luisa; Ninni, Andrea; Capobianco Dondona, Andrea; Ceciarini, Ilaria; Cocumelli, Cristiano; De Lucia, Alessandra; Falconi, Mattia; Formia, Angela; Iacovelli, Federico; Mancusi, Cecilia; Marchiori, Erica; Marsili, Letizia; Mingozzi, Toni; Nannarelli, Stefano; Natali, Chiara; Terracciano, Giuliana; Zuffi, Marco A. L.; Novelletto, Andrea; Ciofi, Claudio |
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